Como adicionar hidrogênios a um arquivo PDB

Para este tutorial, utilizaremos a ferramenta AutoDockTools (ADT) v1.5.7 no sistema operacional Windows 11.

Faça o download do ADT no endereço: https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/

Vamos começar lendo o arquivo PDB. Usaremos neste estudo de caso, a proteína 4bkx.

Abra o ADT, clique no menu File e depois em Read Molecule.

Selecione o arquivo que você deseja abrir.

A estrutura será carregada da seguinte forma: